Podstawą nadania stopnia było oryginalne osiągnięcie technologiczne pod tytułem „System wyznaczania opóźnienia troposferycznego sygnału GNSS w czasie prawie rzeczywistym”. Zostało ono utrwalone w postaci oprogramowania oraz wdrożone do wykonywania zautomatyzowanych obliczeń w Instytucie Geodezji i Geoinformatyki IGiG UPWr dla obszaru Polski i Litwy oraz w SPACE Research Centre (Royal Melbourne Institute of Technology University, Melbourne, Australia) dla obszaru stanu Victoria w Australii. Celem naukowym osiągnięcia habilitacyjnego było zbudowanie i rozwój pionierskiego w Polsce i Australii zautomatyzowanego systemu wyznaczania opóźnienia troposferycznego w czasie prawie rzeczywistym z obserwacji GNSS.
Dr Jan Kapłon ponadto jest autorem 14 prac z listy JCR opublikowanych po uzyskaniu stopnia doktora. Sumaryczny Impact Factor jego prac wynosi 23.206, a indeks Hirscha – 7 (według Web of Science Core Collection). Habilitant brał udział w 17 projektach badawczych, w tym w dwóch jako kierownik zadania (m.in. EPOS-PL). Opracował 11 ekspertyz i innych opracowań na zamówienie.
Dorobek naukowy dr. Kapłona uzupełnia 96 referatów i posterów zaprezentowanych na krajowych i międzynarodowych konferencjach naukowych. Habilitant odbył dwa staże w zagranicznych ośrodkach naukowych. Był także opiekunem 48 prac dyplomowych (wypromował 30 inżynierów i 18 magistrów) oraz opiekunem naukowym lub promotorem pomocniczym w trzech przewodach doktorskich. Pełni funkcję kierownika dwóch przedmiotów na kierunku geodezja i kartografia.